《灵笼》构建了一个末日废土世界，人类在地面被怪兽玛娜生态威胁，幸存者被迫聚集在名为灯塔的浮空城上。马克是灯塔上的猎荒者小队队长，他勇敢坚毅且富有责任感。在一次猎荒行动中，小队遭遇强大噬极兽，战斗异常激烈，队员伤亡惨重。之后，灯塔面临内忧外患，内部宗教势力与科学派矛盾重重，外部还有地面怪物的潜在威胁。马克意外发现地面存在新的人类生存迹象，这让他对灯塔一直宣扬的理念产生怀疑。随着探索深入，关于人类起源、玛娜生态的秘密逐渐浮出水面，马克等人在不断战斗与抉择中，为人类的未来而拼搏。