《轮回的拉格朗日第二季》延续前作故事，舞台依旧围绕着伊豆大岛。主角们所在的女子高中生偶像团体“Lagrange Point”继续活跃着。在这一季中，她们面临着新的挑战与危机。来自宇宙的神秘势力再次降临，企图破坏地球与拉格朗日点之间的平衡。美空、阳菜、莉奈等女孩们不仅要应对偶像活动中的各种事务，还要驾驶着特殊的机体与敌人战斗。她们在战斗中不断成长，彼此之间的羁绊也更加深厚。在一次次的战斗和困难面前，女孩们逐渐明白了守护的意义，最终凭借着勇气和团结，成功击退了敌人，守护了地球和拉格朗日点的和平。