《魔法老师！～另一个世界～》围绕着涅吉·史普林菲尔德展开。涅吉是一位年轻的魔法老师，来到麻帆良学园担任英语教师，同时还肩负着寻找魔法石以拯救祖国的使命。在学园里，他要面对一群性格各异的女学生，像性格大大咧咧的神乐坂明日菜、傲娇的近卫木乃香等。随着故事推进，涅吉和学生们的羁绊逐渐加深，他们一起经历了各种魔法战斗。这些战斗不仅来自邪恶魔法组织的威胁，还涉及到不同魔法世界的纷争。在一次次的冒险中，涅吉和学生们不断成长，共同守护着学园和身边的人，谱写了一段充满魔法与友情的热血故事。