《扑杀天使2》延续了前作的奇幻搞笑风格。故事围绕着高中生结城浩一展开，他原本过着普通的生活，却突然被来自天界的小不点天使沙夏“缠上”。沙夏奉上级命令来“扑杀”浩一，原因是浩一的前世犯下大罪。在这一部中，浩一和沙夏之间依旧冲突不断，沙夏各种奇葩的扑杀手段层出不穷，却总是以失败告终。同时，新角色的加入让故事更加丰富，他们之间发生了一系列令人捧腹大笑又充满温情的故事，展现出别样的校园奇幻生活。