《她的神明偏爱她》以少女林悦和少年沈泽的故事为主线。林悦性格内向，在学校常被同学欺负，内心自卑又孤独。而沈泽则是校园里的风云人物，成绩优异、阳光帅气。一次偶然机会，沈泽看到被欺负的林悦，心中涌起保护欲，开始默默关注她。 沈泽会在林悦被孤立时，主动和她搭话；在她学习遇到困难时，耐心为她讲解。随着相处，林悦逐渐打开心扉，两人关系愈发亲密。然而，沈泽家庭突遭变故，他不得不面临转学。林悦得知后，内心痛苦又无助。但沈泽承诺会回来找她。多年后，沈泽归来，此时的林悦已在他的影响下变得自信坚强，两人再次相遇，续写了这段被神明偏爱的爱情故事。