《三尖树时代》故事发生在一个充满危机的世界。主人公比尔在一场神秘的流星雨灾难中失明，当他重见光明时，发现世界已天翻地覆。原本被人类当作生物能源的三尖树，因流星雨带来的影响获得了行动能力和攻击性，它们开始对人类展开疯狂攻击。比尔结识了同样幸存的女子乔丽，二人与其他幸存者一起，在这个被三尖树统治的世界努力求生。他们不仅要躲避三尖树的追杀，还要应对食物短缺、其他幸存者之间的矛盾等问题。在不断逃亡和战斗的过程中，比尔等人逐渐探寻到三尖树的弱点，试图寻找重建人类社会的希望。