《我的被窝藏女神》围绕平凡青年林羽展开。林羽本是个为生活奔波的普通上班族，一次意外让他的被窝里出现了神秘女神苏瑶。苏瑶拥有超凡能力，却因未知原因被困在林羽的被窝。林羽起初惊慌失措，但在与苏瑶的相处中，两人逐渐建立起信任。他们一同面对生活中的种种难题，苏瑶用超能力帮助林羽解决工作危机，林羽则在生活上照顾苏瑶。然而，他们的秘密被心怀不轨的人发现，由此引发一系列惊险刺激的故事。在共同应对危机的过程中，林羽和苏瑶的感情也悄然升温。