《致命录像带99》以伪纪录片形式呈现，由多个恐怖故事交织而成。故事设定在1999年，包含了不同风格的恐怖元素。有外星怪物入侵小镇的情节，外星生物肆虐，居民们在恐惧中挣扎求生，录像记录下他们绝望的逃亡和与怪物的惊险对抗。还有神秘宗教仪式相关的故事，信徒们进行着诡异的仪式，背后隐藏着不可告人的秘密，随着仪式推进，恐怖氛围不断升级。另外，在一个偏远的军事基地，士兵们遭遇了超自然现象，录像捕捉到基地内发生的离奇事件，他们逐渐陷入疯狂与死亡的深渊。这些故事通过录像带的形式拼接，营造出强烈的真实感和恐怖氛围，让观众仿佛置身于那个充满未知与恐惧的1999年。