《河童之子》以少年信雄的经历展开。信雄自幼被人类夫妇收养，却不知自己是河童之子。在成长过程中，他因身上的种种河童特征而遭受周围人的异样眼光和欺负。一次偶然的机会，信雄得知了自己的身世秘密。为了寻找真正的自我和归属感，他踏上了前往河童世界的旅程。在这个过程中，他结识了许多善良的河童朋友，也遭遇了各种困难和挑战。他逐渐学会运用自己的河童能力，与伙伴们共同克服难关。最终，信雄在河童世界找到了属于自己的位置，也明白了人类世界与河童世界之间的联系和情感纽带。