东京湾新设施“海洋边缘”举办的峰会现场发生了大规模爆炸，公安警察在爆炸现场发现了毛利小五郎的指纹，小五郎因此被捕。柯南为了洗清毛利小五郎的嫌疑，开始展开调查。在调查过程中，柯南结识了公安警察安室透，安室透似乎对案件有所隐瞒，两人之间产生了微妙的对立。随着调查深入，柯南发现这起爆炸案背后隐藏着一个涉及公安内部权力斗争的巨大阴谋。他需要在有限的时间内找出真正的凶手，阻止更大的危机发生。影片中柯南凭借着自己的智慧和推理能力，抽丝剥茧，解开重重谜团，最终成功破解案件，还小五郎清白，也避免了一场更大的灾难。