《再见箱舟》以明治维新时期为背景，主角胜海舟是一位颇具影响力的幕府官员。当时日本局势动荡，幕府统治摇摇欲坠，新政府势力崛起，双方剑拔弩张。胜海舟深知战争会给国家和人民带来巨大灾难，于是他不顾重重压力，积极奔走。他与西乡隆盛等新政府代表进行艰难谈判，凭借自己的智慧和威望，避免了江户城的一场血腥大战，实现了和平交接。在这个过程中，胜海舟面临着幕府内部的质疑与反对，也承受着新政府方面的试探与压力，但他始终坚守和平的信念。最终，他成功化解了危机，为日本的近代化转型奠定了基础，也完成了自己的使命，与过去的时代告别。