《人类削减计划》设定在人类人口过剩的未来世界，政府为了控制人口数量，实施了残酷的“人类削减计划”。主角藤堂和泉是一名普通学生，他原本过着平凡的生活，却被卷入这场恐怖的计划中。在这个计划里，学生们被集中到一个封闭场所，必须在规定时间内完成指定任务，否则就会被无情抹杀。藤堂和泉与好友们一起，在充满陷阱和危险的环境中艰难求生。他们不仅要面对来自外界的致命威胁，还要应对同学之间为了生存而产生的背叛与争斗。在不断的挣扎和战斗中，他们逐渐成长，努力寻找着打破这个残酷计划的方法，为生存和自由而战。