《天空之蜂》围绕着一场惊心动魄的危机展开。一架装载着炸弹的直升机被恐怖分子操控，悬停在核反应堆上空，只要直升机高度低于 300 米或者飞行超过 100 公里，炸弹就会爆炸，引发核灾难。自卫队特殊部队、警察以及核能专家三岛贤治等人纷纷卷入其中。三岛贤治原本是核能的支持者，但在这场危机中，他不得不与各方合作寻找解决办法。随着调查深入，背后的真相逐渐浮出水面，涉及到对核能安全的质疑和不同利益集团的博弈。各方在紧张的时间里争分夺秒，既要避免炸弹爆炸，又要解开谜团，最终能否化解这场核危机，成为影片最大的悬念。