《两不疑第二季》延续第一季的精彩，大景朝皇帝萧锦昀与皇后徐钰意外互换身体后，在第一季经历了诸多啼笑皆非又温暖感人的故事。第二季中，两人虽换回了身体，但此前身体互换的经历让他们对彼此有了全新的认知。朝堂之上，萧锦昀在处理政务时会更多考虑徐钰曾提出的见解，而徐钰也更理解皇帝的不易。然而，新的危机接踵而至，朝中奸臣暗中勾结，企图颠覆朝纲。萧锦昀和徐钰携手应对，徐钰凭借在互换身体时积累的朝堂经验，为萧锦昀出谋划策。他们在一次次困境中相互扶持，感情也愈发深厚，共同守护着大景朝的安稳与繁荣。