《奇异博士 动画版》围绕着天才外科医生斯蒂芬·斯特兰奇展开。斯特兰奇原本凭借精湛医术在医学界声名远扬，然而一场严重车祸让他双手受伤，无法再操刀手术。心灰意冷的他踏上寻找治愈方法的旅程，来到了卡玛泰姬。在这里，他拜古一法师为师，学习神秘的魔法知识和技能。斯特兰奇逐渐掌握了各种魔法，成为了一名强大的魔法师——奇异博士。此后，他肩负起守护地球、对抗邪恶势力的重任。他多次与妄图破坏世界和平的黑暗力量战斗，利用魔法神器和自身能力，一次次化解危机，保护着人类世界免受超自然威胁。