《魔法少女伊莉雅第三季》延续前作，故事围绕着伊莉雅丝菲尔·冯·爱因兹贝伦展开。伊莉雅原本是普通女孩，却因卷入圣杯战争，成为魔法少女。本季中，新的敌人不断涌现，神秘的黑影组织妄图利用强大的魔法道具达成邪恶目的。伊莉雅与好友美游、露维亚等人并肩作战，她们在战斗中不断成长，魔法能力也日益增强。在一次激烈交锋里，伊莉雅为保护同伴，陷入绝境，但凭借坚定信念突破自我，释放出强大魔法。同时，本季也深入挖掘了角色内心世界，展现了伊莉雅对友情、亲情的珍视，以及面对困难时的勇敢与坚持。