《南少林之怒目金刚》以清朝为背景，围绕着南少林展开故事。南少林一直是正义的象征，却遭到朝廷鹰犬的觊觎和迫害。主人公林展鹏本是南少林的俗家弟子，武艺高强且心怀正义。朝廷鹰犬为了剿灭南少林，设计陷害，使得南少林陷入危机。林展鹏在这场浩劫中，亲眼目睹了同门的牺牲和寺庙的被毁。悲愤交加的他决定挺身而出，与邪恶势力展开对抗。他凭借着南少林的绝学，一次次化险为夷。在战斗过程中，他结识了一群志同道合的江湖义士，他们一同并肩作战，历经无数艰难险阻，最终成功挫败了朝廷鹰犬的阴谋，为南少林报仇雪恨，也让正义得以伸张。