《代号基亚斯：复活的鲁路修》承接《Code Geass 反叛的鲁路修》剧情。鲁路修曾以 Zero 的身份掀起反抗布里塔尼亚帝国的浪潮，最后在朱雀协助下以自己的死亡换来了世界和平。然而，影片中鲁路修竟奇迹般复活。此时，神秘组织“复活的鲁路修”出现，他们打着鲁路修的旗号制造混乱。真正的鲁路修苏醒后，面对这复杂局面，不得不再次卷入纷争。他与旧友 C.C.重逢，还和娜娜莉等亲人有了新的情感纠葛。在这个过程中，鲁路修要重新集结力量，对抗新的敌人，解开神秘组织背后的阴谋，同时还要在守护世界和平与个人情感之间艰难抉择，再次为了理想中的世界而战。