大雄在河边捡到了两颗恐龙蛋，在哆啦A梦的道具帮助下，蛋孵化出了两只可爱的小恐龙，一雄一雌，大雄分别给它们取名为小咻和小咪。为了让小恐龙能有更适合的成长环境，他们借助时光机回到了白垩纪。然而，他们遭遇了肉食恐龙的攻击，小咻和小咪为保护大家陷入危险。之后，他们又得知白垩纪即将面临陨石撞击的灭顶之灾。为了拯救小恐龙们，大雄、哆啦A梦和伙伴们齐心协力，想尽办法带着恐龙们躲避灾难，在这个过程中，他们经历了无数艰难险阻，也收获了深厚的友谊和勇气，最终成功帮助恐龙们度过危机。