《机动战士高达：库库鲁斯·多安的岛》故事发生在一年战争结束后。地球联邦军军官阿尔黛西亚·米尔奇奉命调查一起吉翁残党走私武器事件，她来到了一座名为“库库鲁斯·多安的岛”的地方。在这里，她遇到了自称多安·沃尼克的男人，他经营着一家孤儿院。然而，多安的真实身份其实是吉翁公国王牌机师库库鲁斯·多安。随着调查深入，阿尔黛西亚逐渐察觉到多安的秘密。多安曾在战争中有着辉煌战绩，但如今他渴望远离战争，守护孤儿院的孩子们。联邦军的步步紧逼，让多安不得不再次面对曾经的战场，一场激烈的冲突在这座小岛上爆发，多安将如何在守护孩子与面对过去之间做出抉择，成为故事的一大看点。