《布鲁特斯的心脏》围绕着末永拓也展开，他是MM重工的精英社员，同时与社长女儿雨宫康子和同事仁科直树的情妇神林美智子保持着关系。康子意外怀孕，以此要挟拓也结婚。为摆脱困境，拓也与直树、桥本密谋了一个“机器人计划”，准备在运送机器人的过程中杀害康子，并互相为彼此提供不在场证明。然而，计划实施过程中却意外频发，桥本离奇死亡，现场还留下了“布鲁特斯”的字样。随着调查深入，拓也发现事情远没有那么简单，自己似乎陷入了一个精心设计的圈套，而真相背后隐藏着令人震惊的秘密，各方人物的命运也因此发生了巨大的改变。