《少女杀手阿墨》讲述了少女阿墨的传奇故事。阿墨自幼被训练成冷酷杀手，在黑暗世界中执行各种危险任务。一次行动里，她遇到了善良的男孩小阳，小阳的温暖与真诚逐渐融化了阿墨冰冷的心。然而，阿墨所在的杀手组织得知此事后，对她下达了格杀令。阿墨一边要躲避组织的追杀，一边还要保护小阳。在逃亡过程中，阿墨不断回忆起自己痛苦的过去，也更加坚定了反抗组织的决心。最终，阿墨凭借着自己的智慧和勇气，与组织展开了一场惊心动魄的决战，成功摆脱了杀手的命运，迎来了新的生活。