《少年特工》围绕一群少年军校学员展开。调皮捣蛋的张小培、憨厚老实的迟海、聪明伶俐的肖妮等性格各异的孩子，因不同原因汇聚到少年军校。他们在这里开启了充满挑战与成长的特工训练生活。训练过程困难重重，高强度的体能训练、复杂的特工技能学习让他们吃尽苦头。张小培常因调皮惹出麻烦，在野外生存训练中擅自行动导致迷路，但在大家的帮助下化险为夷。在一次次任务和训练中，少年们逐渐成长，学会了团队合作、责任担当。他们还凭借智慧和勇气，成功挫败了敌特的阴谋，保卫了国家机密。这部剧展现了少年们从懵懂到成熟的蜕变，充满了青春活力与正能量。