在日本，工业污染日益严重，垃圾堆积如山。这些垃圾在神秘力量作用下，竟孕育出恐怖怪兽黑多拉。黑多拉身体由无数微生物聚合而成，能不断吸收垃圾壮大自己，所到之处环境污染加剧，城市陷入危机。与此同时，哥斯拉出现，它原本在海洋中平静生活，黑多拉的肆虐打破了这份宁静。人类深知仅靠自身力量无法对抗黑多拉，便将希望寄托在哥斯拉身上。哥斯拉与黑多拉展开激烈对决，黑多拉凭借灵活多变的身体和强大再生能力与哥斯拉周旋。战斗中，双方都伤痕累累，但哥斯拉凭借顽强意志和强大力量逐渐占据上风，最终成功击败黑多拉，拯救了城市与人类。