《与君初相识·恰似故人归》分为上下两部，上部《与君初相识》，下部《恰似故人归》。故事围绕着御灵师纪云禾和鲛人长意展开。纪云禾被困在万花谷，表面为谷主林沧澜办事，实际却被其控制。她遇见了被抓来的鲛人长意，在相处中两人渐生情愫。纪云禾为了长意的自由，设计让他以为自己背叛了他，放他离开。长意误会纪云禾，伤心之下开启复仇之路。 下部中，纪云禾被冰封多年后复活，与长意再次相遇。此时的长意已成为北渊尊主，性情也变得冷漠决绝。但在相处过程中，误会逐渐解开，两人携手对抗多方势力。他们不仅要面对仙师府的压迫，还要应对各方心怀不轨之人的算计。最终，二人历经磨难，共同守护天下苍生，收获了美好的爱情。