《花水木》以北海道钏路为故事起点，主人公平泽纱枝和木内康平在高中时代相遇。康平被纱枝的可爱所吸引，在好友鼓励下向她表白，二人开始交往。然而，康平因父亲工作调动要转去东京，分别之际，他送给纱枝一颗花水木的种子。此后，纱枝为了梦想去东京学医，两人重逢，感情升温。但学医的压力和忙碌让纱枝无暇顾及康平，两人渐行渐远，最终分手。多年后，纱枝成为医生，在一次偶然的机会下与康平再次相遇，此时的他们都已历经生活的磨砺，过去的感情在心中泛起涟漪，他们能否重拾旧爱，花水木又能否见证他们爱情的圆满结局，影片给出了动人的答案。