《我的名字叫可汗》围绕着患有阿斯伯格综合症的穆斯林男子里兹万·可汗展开。他从小生活在印度孟买，因病症行为举止异于常人，但心地善良。长大后，他前往美国，在弟弟帮助下做护肤品销售。一次机缘巧合，他结识了单身母亲曼迪娅，两人相爱并结婚。然而，“9·11”事件爆发，美国国内掀起反穆斯林浪潮，曼迪娅的儿子因是穆斯林后裔被欺负致死，她迁怒于可汗，让他去告诉总统“我是穆斯林，但我不是恐怖分子”。于是，可汗踏上了漫长的旅程，一路上他历经艰辛，遭遇各种歧视与误解，但始终坚持。最终，他在一场混乱的集会上见到总统，说出了那句话，也与曼迪娅重归于好。