故事始于上世纪60年代的冷战时期。年轻的查尔斯·泽维尔，也就是后来的X教授，拥有强大的心灵感应能力，他结识了同样具有特殊能力的埃里克·兰谢尔。埃里克因纳粹对犹太人的迫害，一心想要向杀害母亲的纳粹军官施密特复仇。施密特妄图利用变种人的力量挑起美苏战争，进而统治世界。查尔斯和埃里克为阻止施密特的阴谋，召集了一群年轻的变种人，组成了最初的X战警。在这个过程中，查尔斯和埃里克因对待人类的态度产生分歧，查尔斯主张变种人与人类和平共处，埃里克则认为变种人应统治人类。最终，他们在古巴导弹危机的关键时刻挫败了施密特的计划，但两人也分道扬镳，为后续的故事埋下了伏笔。