《君吻》以濑户灿所在的高校为背景展开故事。濑户灿是个平凡的高中生，他一直暗恋着青梅竹马的南云菜菜香，然而菜菜香却有了男朋友，这让灿陷入了苦恼。与此同时，转校生黑川真矢对灿产生了好感，真矢性格直爽，主动向灿表达心意，这让灿的内心泛起了涟漪。 除了灿的感情线，学校里其他同学也有着各自的情感故事。星乃结美一直默默喜欢着老师，在经历了一系列事情后，她逐渐明白了自己感情的方向。而白河萤和二见瑛理子之间也有着复杂的情感纠葛。 这部动画细腻地描绘了青春期少年少女们纯真而又懵懂的爱情，通过多对人物的感情故事，展现了青春时期的迷茫、心动与成长。