《少女终末旅行》的故事发生在人类文明崩坏后的世界，只剩下一片荒芜。主角是千户与尤莉这两位少女，她们驾驶着名为“琪美拉”的小型战车，在废墟中艰难求生。她们没有明确的目的地，只是在这末日中漫无目的地前行。一路上，她们会在废弃的建筑里寻找物资，遇到各种稀奇古怪的事物。比如在一座废弃的图书馆中，她们发现了书籍，从而了解到曾经世界的模样。千户性格冷静理智，擅长机械维修；尤莉则天真活泼，充满好奇心。两人相互陪伴，在这冰冷的世界中给予彼此温暖。她们的旅程没有终点，只有不断地探索与生存，在终末的世界里，她们的友情和对生活的乐观态度显得格外珍贵。