《Rewrite第一季》围绕着天王寺瑚太朗展开。瑚太朗是一名普通高中生，在风祭高校上学。他加入了学校的园艺部，在这里结识了众多性格各异的伙伴，如开朗活泼的千里朱音、神秘的中津静流等。校园生活看似平常，却因一系列超自然现象变得不简单。 故事中，世界存在着两股神秘力量，分别是守护自然的“白”和追求人类发展的“黑”。瑚太朗在与伙伴们的相处中，逐渐卷入了这两股力量的纷争。他发现自己拥有特殊能力，能改写世界的规则。在经历了一系列事件后，瑚太朗开始重新审视人与自然、人类发展与自然平衡的关系。他和伙伴们一起，为了守护心中的正义和世界的未来，踏上了充满挑战的旅程。