《脑海深处》聚焦神经外科领域，以仁华医院神经外科为故事背景。主角傅博文是一位技术精湛但性格孤傲的神经外科医生，他一心扑在手术台上，对患者病情有着精准判断。年轻医生江晓琪怀揣着理想来到仁华医院神经外科，她善良且有冲劲，却在初入科室时因经验不足遭遇诸多难题。科室里还有经验丰富的老医生，他们见证着每一台高难度手术的起起落落。在面对各种复杂的脑部疾病和紧急手术时，医生们不仅要与死神赛跑，还要处理医患之间的信任危机。他们在一次次手术中成长，也在情感的纠葛中不断探寻生命的意义。