《绿岛金魂》围绕着几个年轻人在绿岛发生的一系列故事展开。主角阿川是个一事无成的青年，因债务问题被追讨，无奈之下回到绿岛老家。在岛上，他遇到了儿时好友浩子和小琪。浩子一心想在岛上干出一番事业，小琪则是个性格直爽的女孩。他们听闻岛上流传着一笔神秘的黄金宝藏传说，为了改变现状，三人决定一起寻找宝藏。在寻宝过程中，他们遭遇了各种奇葩状况和困难，还与岛上的恶霸发生冲突。同时，他们也逐渐解开了彼此之间的心结，重新找回了儿时的情谊。随着线索逐渐清晰，他们离宝藏越来越近，然而真相却出乎所有人的意料。