《黑骸》的故事发生在一个被神秘物质“骸”所笼罩的世界。少年黑崎，拥有特殊能力，能与骸产生共鸣。他在一次意外中结识了少女白，白同样与骸有着千丝万缕的联系。他们所在的世界，骸不仅带来了奇异的现象，还引发了各方势力的争夺。黑崎和白为了探寻骸的真相，踏上了充满危险的旅程。一路上，他们遭遇了各种拥有骸能力的敌人，有妄图利用骸统治世界的邪恶组织，也有被骸力量扭曲心智的怪人。在战斗中，黑崎不断挖掘自身潜力，白也发挥出独特的能力协助他。他们在一次次危机中成长，逐渐揭开骸背后隐藏的巨大秘密，而这个秘密将改变整个世界的命运。