《飞天小女警第一季》围绕花花、泡泡和毛毛三位小女警展开。尤教授在一次意外中，将“化学物质X”加入到他调配的“完美小女孩”配方里，从而创造出了这三位拥有超能力的小女警。她们住在小镇村，这里看似平静，实则危机四伏。每一集里，都会有不同的反派出来捣乱，像魔人啾啾，他总是搞出各种破坏，企图统治小镇；还有阿米巴原虫，它能随意变形，制造麻烦。小女警们凭借各自独特的能力应对挑战，花花聪明冷静，是团队的领导者；泡泡天真可爱，拥有超声波攻击能力；毛毛勇敢火爆，拳头威力巨大。她们一次次拯救小镇村，在这个过程中也闹出不少有趣的笑话，展现出小女孩活泼俏皮的一面。