《在世界中心呼唤你》以男主角柯达的视角展开。柯达与转校生亚纪相遇，两人从最初的不打不相识，逐渐互生情愫，开启了一段纯真美好的校园恋情。他们一起在海边漫步，在教室分享秘密，度过了许多甜蜜的时光。然而，亚纪被查出患有重病，这给他们的爱情蒙上了阴影。为了实现亚纪看极光的愿望，柯达带着她踏上了遥远的旅程。在旅途中，他们相互扶持，感情愈发深厚。但最终，亚纪还是离开了人世。多年后，柯达回到曾经与亚纪有过美好回忆的地方，那些过往的点点滴滴不断浮现，他也在回忆中完成了对这段爱情的告别。