《医妃在上，战王在下》围绕女主苏若瑶和战王萧御展开一段跌宕起伏的故事。苏若瑶本是现代医术高超的天才少女，意外穿越到一个架空朝代，成了不受宠的苏家二小姐，还被许配给传闻中冷酷残暴的战王萧御。大婚当日，苏若瑶凭借智慧化解危机，让萧御对她刮目相看。此后，两人在相处中渐生情愫。然而，他们的感情之路并不平坦，朝堂之上各方势力暗流涌动，苏若瑶的身份也被别有用心之人觊觎，多次设计陷害她。但苏若瑶凭借精湛医术和过人谋略化险为夷，还帮助萧御解决诸多难题。两人携手共渡难关，最终收获了甜蜜爱情，也在这乱世中守护了一方安宁。