《信长协奏曲》讲述了现代高中生三郎意外穿越到战国时代，还与织田信长外貌相同。三郎代替信长存活，一边努力适应战国生活，一边卷入各种纷争。他结识了明智光秀、丰臣秀吉等人物，凭借现代知识和善良性格，在乱世中逐渐成长。在与敌人的战斗里，他不断学习战术，带领织田家军队取得胜利。同时，他与身边人的感情也日益深厚。然而，本能寺之变的阴影逐渐逼近，三郎能否改变历史，拯救织田信长和他身边的人，成为故事的一大悬念。