《男子游泳部剧场版：永恒的混合泳之羁绊》延续了电视动画的故事，聚焦松冈凛、七濑遥、橘真琴、叶月渚等水泳部成员。故事中，凛收到澳大利亚游泳队教练的邀请，面临着是否再次前往澳大利亚训练的艰难抉择。与此同时，水泳部迎来了新的挑战，他们要参加一场重要的混合泳接力赛。遥、真琴、渚等人全力备战，努力提升自己的实力。在这个过程中，他们不断克服自身的弱点，彼此之间的羁绊也更加深厚。最终，凛决定回归团队，和伙伴们一起为了梦想而战。他们在赛场上全力拼搏，凭借着坚定的信念和出色的配合，完成了这场意义非凡的比赛，诠释了永恒的混合泳之羁绊。