《京城学校：消失的少女们》故事发生在 20 世纪 30 年代的京城贵族寄宿女校。女学生们接二连三地神秘失踪，学校里弥漫着诡异的氛围。姜智英转学到这所学校后，也被卷入了一系列离奇事件中。她发现学校似乎隐藏着不可告人的秘密，而身边的同学和老师也都行为怪异。智英与好友恩英开始暗中调查，在调查过程中，她们逐渐揭开了学校背后残忍的人体实验真相。原来，日本医生为了进行不人道的研究，将女学生们当作实验对象。最终，智英和恩英勇敢地与邪恶势力展开斗争，试图拯救那些还未遇害的少女们。