《怪物弹珠 THE MOVIE 空之彼方》围绕着少年弹珠战士展开。主角与伙伴们生活在一个怪物弹珠活跃的世界，他们凭借着对怪物弹珠的操控能力守护着自己的家园。然而，平静的生活被打破，一股神秘的邪恶力量从空之彼方袭来，带来了巨大的危机。邪恶势力企图利用强大的怪物弹珠破坏世界秩序，让一切陷入混乱。主角和伙伴们挺身而出，踏上了充满挑战的冒险之旅。他们在旅途中不断结识新的伙伴，收集更强大的怪物弹珠，提升自己的战斗能力。在一次次激烈的战斗中，他们逐渐揭开了邪恶势力的阴谋，最终与邪恶势力展开了一场惊心动魄的决战，为了守护世界的和平而奋力拼搏。