《尼基塔女郎第三季》延续前两季精彩，故事围绕尼基塔展开。她曾是政府秘密组织“Division”的杀手，后叛逃并致力于揭露该组织的阴谋。这一季中，“Division”虽被摧毁，但新的威胁接踵而至。阿曼达重组了一个名为“组织”的新势力，其手段更为隐秘和残忍。尼基塔与迈克尔、亚历克斯等伙伴继续并肩作战，他们不仅要应对“组织”的追杀，还要在复杂的局势中寻找盟友。在一次行动中，尼基塔发现“组织”正在研发一种致命武器，为阻止其扩散，她和团队深入虎穴，历经重重危险。同时，亚历克斯在这一季中逐渐成长，从青涩的特工转变为独当一面的战士，她与尼基塔之间的姐妹情也在战斗中不断升华。而迈克尔与尼基塔之间的感情也面临着新的考验，他们在危险中相互扶持，共同对抗邪恶势力。