春日部防卫队来到了恐龙博物馆，在这里，新之助意外捡到了一本日记，这本日记竟然来自一亿年前的一只小三角龙。小三角龙在日记里记录着自己的生活，它和家人幸福地生活在一起，却遭遇了火山爆发等灾难，与家人失散。新之助和伙伴们被小三角龙的经历深深打动，决定帮助它寻找家人。他们借助神秘力量穿越到了一亿年前的白垩纪。在那里，他们不仅要面对恶劣的自然环境，还要躲避霸王龙等凶猛恐龙的攻击。一路上，小新依旧状况百出，闹出不少笑话，但也凭借着自己的善良和勇气，一次次化险为夷。最终，他们能否帮助小三角龙找到家人，又能否顺利回到现代呢？