《守护甜心!!心跳》承接前作，讲述日奈森亚梦在圣夜学园的全新故事。亚梦依旧带着小兰、美琪、方块和丝武这几个守护甜心，在校园生活中不断成长。学校里转来了新学生边里唯世的表弟三条海里，他担任新的守护者 J ，一开始对亚梦他们充满敌意。 在一次活动中，复活社的人再次搞破坏，亚梦和伙伴们变身对抗。亚梦与小兰变身为 Amulet Heart，发挥出强大的力量。同时，亚梦对唯世的感情也在悄悄变化，而几斗的出现又让这份感情变得更加复杂。几斗为了寻找自己的父亲，与复活社有着千丝万缕的联系。 随着剧情发展，亚梦等人发现复活社的阴谋愈发严重，他们要收集大量坏蛋，将其变成胚胎。亚梦和守护者们一次次阻止复活社的行动，在战斗中，亚梦不断解锁新的变身形态，如与方块变身的 Amulet Dia ，拥有更强大的能力。他们在守护圣夜学园的同时，也在守护着孩子们心中的梦想。