《末日迷踪：敌基督的崛起》延续了前作的故事，将观众带入一个被末日阴影笼罩的世界。飞机上乘客离奇消失，引发全球恐慌。主人公雷福德·斯蒂尔是一名飞行员，经历了飞机上的诡异事件后，他开始探寻背后的真相。此时，神秘人物尼古拉·卡帕西登场，他凭借卓越的口才和政治手腕迅速崛起，成为世界瞩目的焦点。然而，雷福德等人逐渐发现卡帕西的真实身份是敌基督，他妄图掌控世界，带来更多的灾难。雷福德与一群信徒联合起来，一边躲避卡帕西的追捕，一边努力唤醒更多人认清真相，在末世的混乱中为生存和信仰而战。