《五岛医生诊疗所》围绕着五岛健助医生展开。五岛医生毕业于东京医科大学，却来到了孤悬海上的志木那岛行医。岛上医疗条件简陋，居民们对这位年轻医生起初也心存疑虑。但五岛医生凭借着精湛的医术和温和善良的性格，逐渐赢得了大家的信任。 有一次，岛上的孩子突发重病，病情危急，五岛医生冷静诊断，迅速制定治疗方案，成功挽救了孩子的生命。还有渔民出海受伤归来，五岛医生不顾疲惫立刻进行救治。在与居民们的相处中，他不仅治疗身体上的疾病，还关心他们的生活与心理。随着时间推移，五岛医生成为了岛上不可或缺的存在，他与居民们建立了深厚的情谊，也在这座小岛上找到了自己从医的真正意义。