《高中舰队剧场版》承接电视动画剧情，故事中，女高中生们所在的舰队在海上持续着冒险。铃谷、熊野等少女们依旧在军舰上为了各种任务而努力。剧场版里，舰队遭遇了更为强大的敌人，面临着前所未有的危机。敌人的攻击猛烈，舰队的舰船受损严重，少女们的生命也受到威胁。然而，她们没有退缩，凭借着坚定的信念和出色的战斗技能，重新组织力量。在战斗过程中，少女们之间的友情得到进一步升华，她们相互支持、配合，共同制定作战计划。最终，她们成功击退敌人，化解了危机，继续在大海上展开新的征程，展现出青春无畏与团结的力量。