《灵媒侦探城塚翡翠》围绕灵媒城塚翡翠和推理作家香月史郎展开。城塚翡翠拥有能够通过触碰死者来与灵沟通获取线索的能力，香月史郎则擅长推理。起初，香月并不完全相信翡翠的灵媒能力，但在合作解决案件的过程中，逐渐改变了看法。 他们共同面对多起离奇案件，比如在某起谋杀案中，现场线索极少，翡翠借助灵媒能力得到一些模糊提示，香月则凭借推理抽丝剥茧。随着调查深入，两人配合愈发默契。然而，故事后期出现反转，原来翡翠的能力背后有着不为人知的秘密，她和香月之间的关系也变得更加复杂，案件真相也在一次次的推理与揭秘中逐渐浮出水面。