《哈兰·科本的庇护所》围绕少年米基·博利塔展开。米基的父亲离世后，他和母亲搬到新泽西州的小镇与舅舅生活。在新环境里，米基结识了新朋友，然而平静的生活很快被打破。他的好友阿什莉突然失踪，这一事件成为故事的导火索。米基决定自行展开调查，在追寻真相的过程中，他发现小镇隐藏着诸多秘密和不可告人的阴谋。随着调查深入，米基遭遇了各种危险和挑战，还与神秘组织产生冲突。他凭借自己的智慧和勇气，逐步揭开层层迷雾，试图找出阿什莉失踪的真正原因以及背后的黑手。